水波摩斯拉登场于1997年，电影魔斯拉二（海底大决战），它是彩虹魔斯拉，为了应对栖息于海域的怪兽达哥拉转换形态而形成的摩斯拉，虽然本体依然是彩虹魔斯拉，但是其造型和彩虹魔斯拉一对比，可就大相迳庭了。水波摩斯拉为了在水中能够进行快速流动作战，整体身躯呈现优美的流线型，头部相比于彩虹魔斯拉的圆润变得更加棱角分明，充满凌厉感，触角相比于彩虹摩斯拉也长了好几倍，水波摩斯拉身躯改变最大的就是它的翅膀，翅膀颜色依旧如彩虹摩斯拉一样，是鲜艳的彩虹色，但是造型变成类似鱼鳍的形状，共有四片呈X型分布，尾部末端也得出一个三叉形尾鳍，这些参考鱼类的设计都是为了在水中战斗更具优势。能力方面，水波摩斯拉头部触角处能发射出波动热光线，在水中游动能将水作为盾牌形成波动屏障进行防御，全身蓄满能量发光后，能将这些能量以光线的形式发射出去，光线造型适合自身一样的X型，能进行连续发射，水波摩斯拉还能将自身缩小进行分身，潜入敌人体内破坏，在影片中怪兽达哥拉，意图破坏古代文尼拉加纳的遗迹，为了保护遗迹而受伤的绿魔斯拉吸收了生命之水后。进化成了彩虹摩斯拉。彩虹摩斯拉对潜入海底的达哥拉束手无策，为了追击达哥拉彩虹摩斯拉转变形态变成了水波摩斯拉水波摩斯拉进入海底后变成了一具大杀器，面对达哥拉的光线攻击，他的用波动屏壁防御进攻则使用威力强大的波动热光线和X光线。在攻守两端都展现出绝对的优势，稳稳的压制住了达哥拉，最终水中摩斯拉缩小自身身躯，分身成多个幻影，潜入达哥拉体内，由内而外进行破坏，成功击败了达哥拉。